• 首页
  • 组织机构
    • 热科院概况
    • 院领导集体
    • 机构设置
    • 发展规划
  • 科技创新
    • 通知公告
    • 政策法规
    • 科技热点
    • 科研基地
  • 成果转化
    • 转化动态
    • 转化平台
    • 合作企业
    • 技术成果
    • 良种良苗
    • 科技产品
  • 人才队伍
    • 人才动态
    • 人才招聘
    • 人才政策
    • 创新团队
    • 专家风采
    • 专家库
  • 国际合作
    • 国际合作与交流
    • 合作平台与伙伴
    • 对外合作政策
  • 服务三农
    • 热区"三农"
    • 院地合作基地
  • 党建文化
    • 党建工作
    • 反腐倡廉
    • 统战工作
    • 群工工作
    • 文化建设
    • 学习交流
  • 教育培训
    • 研究生教育
    • 培训中心
当前位置:首页 » 要闻聚焦 » 详细
中国热科院发布西番莲染色体级别精细基因组
作者:科技处 海口站 来源:中国热带农业科学院 日期:2021-01-22

  近日,中国热科院海口实验站西番莲育种高效栽培研究团队在西番莲染色体级别基因组解析和风味物质合成机理研究方面取得重要进展。


  研究团队利用Illumina、Nanopore、Hi-C测序,采用NextDenovo + SMARTdenovo + NextPolish策略组装,获得~1341.7 Mb的基因组,经与其它19种近缘植物基因家族比较分析,发现西番莲与大戟科(蓖麻,橡胶树和木薯)亲缘关系最密切,发布西番莲染色体级别基因组,明确百香果的进化地位;此外,从基因组、转录组和代谢组等多组学角度挖掘了影响西番莲风味的潜在基因和基因家族,明确α-亚麻酸代谢、代谢途径和次生代谢途径是参与西番莲风味形成过程中重要挥发性有机物(VOCs)合成的主要途径,为西番莲的改良栽培提供宝贵的资源。


  该项工作相关研究结果,以题为:“Chromosome-scale genome assembly provides insights into the evolution and flavor synthesis of passion fruit (Passiflora edulis Sims) ”在中科院JCR一区的TOP期刊《Horticulture Research》发表。中国热科院海口实验站黄东梅助理研究员、海南大学夏志强副教授、齐鲁工业大学张圣奎博士为共同第一作者,中国热科院海口实验站宋顺副研究员、詹儒林研究员为通讯作者。该项工作得到了中国热带农业科学院专项资金支持。


  文章链接:https://www.nature.com/articles/s41438-020-00455-1


image.png

西番莲花果形态和基因组图谱


image.png

西番莲基因组的进化分析结果


image.png

西番莲脂肪酸代谢及萜类生物合成途径的表达热图及代谢产物含量

  • Copyright © 中国热带农业科学院监制
  • 地址:海南省海口市城西学院路4号
  • 邮编:571101
  • 琼公网安备 46010602000325号
  • 琼ICP备11000394号
English | 旧版
  • 首页
  • 组织机构
    • 热科院概况
    • 院领导集体
    • 机构设置
    • 发展规划
  • 科技创新
    • 通知公告
    • 政策法规
    • 科技热点
    • 科研基地
  • 成果转化
    • 转化动态
    • 转化平台
    • 合作企业
    • 技术成果
    • 良种良苗
    • 科技产品
  • 人才队伍
    • 人才动态
    • 人才招聘
    • 人才政策
    • 创新团队
    • 专家风采
    • 专家库
  • 国际合作
    • 国际合作与交流
    • 合作平台与伙伴
    • 对外合作政策
  • 服务三农
    • 热区"三农"
    • 院地合作基地
  • 党建文化
    • 党建工作
    • 反腐倡廉
    • 统战工作
    • 群工工作
    • 文化建设
    • 学习交流
  • 教育培训
    • 研究生教育
    • 培训中心

重要新闻

  • 海南省委书记沈晓明看望慰问中国热科院专家
  • 中国热科院揭示红皮龙眼果皮花色苷形成机制
  • 中国热科院博士后科研工作站综合评估成绩优秀
  • 国家热带牧草标本馆揭牌——我国南方第一个牧草专类标本馆正式投入使用
  • 中国热科院与联合国粮农组织共同举办“一国一品”特色农产品绿色发展全球行动计划咨询会
  • 王庆煌院长出席香饮所新大门揭牌仪式 强调加快推进兴隆热带植物园“二次创业”
    持续打造热带香辛饮料科技工程

热区热点

  • 首届中国国际热带博览会在广东佛山举办

  • 澄迈扎实推进农业高质量发展 桥头地瓜等入选中国农业品牌名录

专题推荐

当前位置:>首页>要闻聚焦

中国热科院发布西番莲染色体级别精细基因组

  作者: 科技处 海口站   来源: 中国热带农业科学院  日期: 2021-01-22   点击: [ 小  中  大   打印  ] 我要分享

  近日,中国热科院海口实验站西番莲育种高效栽培研究团队在西番莲染色体级别基因组解析和风味物质合成机理研究方面取得重要进展。


  研究团队利用Illumina、Nanopore、Hi-C测序,采用NextDenovo + SMARTdenovo + NextPolish策略组装,获得~1341.7 Mb的基因组,经与其它19种近缘植物基因家族比较分析,发现西番莲与大戟科(蓖麻,橡胶树和木薯)亲缘关系最密切,发布西番莲染色体级别基因组,明确百香果的进化地位;此外,从基因组、转录组和代谢组等多组学角度挖掘了影响西番莲风味的潜在基因和基因家族,明确α-亚麻酸代谢、代谢途径和次生代谢途径是参与西番莲风味形成过程中重要挥发性有机物(VOCs)合成的主要途径,为西番莲的改良栽培提供宝贵的资源。


  该项工作相关研究结果,以题为:“Chromosome-scale genome assembly provides insights into the evolution and flavor synthesis of passion fruit (Passiflora edulis Sims) ”在中科院JCR一区的TOP期刊《Horticulture Research》发表。中国热科院海口实验站黄东梅助理研究员、海南大学夏志强副教授、齐鲁工业大学张圣奎博士为共同第一作者,中国热科院海口实验站宋顺副研究员、詹儒林研究员为通讯作者。该项工作得到了中国热带农业科学院专项资金支持。


  文章链接:https://www.nature.com/articles/s41438-020-00455-1


image.png

西番莲花果形态和基因组图谱


image.png

西番莲基因组的进化分析结果


image.png

西番莲脂肪酸代谢及萜类生物合成途径的表达热图及代谢产物含量

  

360网站安全检测平台

Copyright © 中国热带农业科学院监制

地址:海南省海口市城西学院路4号 邮编:571101

琼公网安备 46010602000325号 琼ICP备11000394号